不知道你是A股主板转三板，还是原始股新三板上市，不管哪一个，只要是你的1000股在一个股票账户上，就是完全转移，不会遗漏。
A股可以有不止一个账户，可以在不同券商处开户，这是有可能造成没有完全转移到三板托管券商的。
公司缩股转三板或缩股新三板上市也是可能的，请查询相应股票的公开信息，或咨询开户的券商客服。